最新情報

ProNITデータのXMLの更新(2011年04月28日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2011年04月28日) 詳細....

ProNITデータの更新(2011年04月28日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2011年04月27日) 詳細....

ProThermデータの更新(2011年04月27日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2011年03月30日) 詳細....

ProThermデータの更新(2011年03月30日) 詳細....

ProNITデータのXMLの更新(2011年03月25日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2011年03月25日) 詳細....

ProNITデータの更新(2011年03月25日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2011年02月17日) 詳細....

ProThermデータの更新(2011年02月17日) 詳細....

ProNITデータのXMLの更新(2011年02月17日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2011年02月17日) 詳細....

ProNITデータの更新(2011年02月17日) 詳細....

ProNITデータのXMLの更新(2010年12月24日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年12月24日) 詳細....

ProNITデータの更新(2010年12月24日) 詳細....

ProNITデータのXMLの更新(2010年11月5日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年11月5日) 詳細....

ProNITデータの更新(2010年11月5日) 詳細....

ProNITデータのXMLの更新(2010年08月31日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年08月31日) 詳細....

ProNITデータの更新(2010年08月31日) 詳細....

PDB構造からProNITエントリーへの直接リンク(2010年08月20日) 詳細....

PDB構造からProThermエントリーへの直接リンク(2010年08月20日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年08月17日) 詳細....

ProThermデータの更新(2010年08月17日) 詳細....

ProNITデータのXMLの更新(2010年07月26日) 詳細....

熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年07月26日) 詳細....

ProNITデータの更新(2010年07月26日) 詳細....

概要

九工大では、文科省の統合データベースプロジェクトの一環として、 蛋白質の安定性や相互作用の網羅的な熱力学データと構造データとの統合化を進めています。
統合化として具体的には以下のことを進めています。
1.熱力学情報と構造情報のクロスリファレンスの作成
  九工大の熱力学データとPDBjの構造データを対応づけるクロスリファレンステーブルを作成します。 クロスリファレンステーブルを元に、九工大が以前から構築している蛋白質熱力学データベース(ProTherm)、 蛋白質・核酸相互作用データベース(ProNIT)と、PDBjとの間に、双方向にリンクを作成します。
  ProTherm: 蛋白質の熱力学データベース
  ProNIT: 蛋白質・核酸相互作用データベース
2.オントロジーの整備
  熱力学データのオントロジーを整備します。
  Controlled Vocabulary for Thermodynamic Databases
3.データ交換フォーマットの整備
  XMLなど、熱力学データのデータ交換フォーマットを整備します。
  ProThermのXMLデータ
  ProNITのXMLデータ(暫定版)
また、ライフサイエンス統合データベースセンターと連携して、 テキストマイニングによる論文の自動収集やデータの自動抽出を実施します。